常两者之间的关系不超过两代，而且均不是对方的祖先。在此定义之下，夫妻双方最远的关系是其祖父、祖母、外祖父、外祖母之中，只有一位是共同的。值得注意的是，在此定义之中排除了母子联姻或孙女嫁祖父等情形，这个理由将会在直系交配的章节进行讨论。一对近亲交配所能连到的极致，就是兄妹或姊弟通婚，这种近亲交配可以很容易地连续进行数个世代。较疏离的近亲交配但是持续好几个世代，所产生的效应远胜于一代之中的亲密近亲通婚。

近亲交配将使隐性基因处于同种胚子的纯种环境之中，由于这些基因有可能是良好的，也有可能是不可取的，所以近亲通婚的结果，变异性相当大。而近亲交配结果的好坏，则取决于原始族群所具有之隐性基因的良莠而定。

其实近亲交配本身并没有任何不良影响，这项理论已经由费城卫斯特学会(the Wister Institute in Philadelphia)的海伦狄恩.金(Helen Dean King)博士几近确定地证实了。她所饲养的老鼠，超过一百代以上都是兄妹或姊弟通婚，所得到的结果发现，最终世代的老鼠与她实验起始时的老鼠比较起来，体型变大、寿命延长，而且可以生育较大的幼鼠。之所以可以得到如此优良的结果果，应该归因于实验中非常仔细的筛选过程，凡是不可取的实验鼠都被摧毁，只留下最优秀的动物进行育种。假使一族鸽子的血统中有不良的基因存在，则它们应该全部被消灭，否则这个不良基因将继续在其后代之中出现。

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