用化学或物理的方法杀灭有害微生物的过程就叫做消毒；而清洁卫生是把被污染的微生物减少到能保持安全程度的各项措施。杀菌剂是迅速杀灭细菌的化学药品；而防腐剂则是抑制细菌生长繁殖的药物。　　
鸽常用的消毒药物一般可分以下两个方面：
1、外科用的消毒药物　　
此类药物常用于皮肤和器械的消毒；也用于黏膜、蛋及用具的消毒；还可适用于洗涤污秽、坏死和有臭气的陈旧创口或新的创伤、溃疡以及作鼻炎和眼结膜的冲洗剂等等。具体的则分述如下：
A、酒精（乙醇）。 一般微生物遇到酒精后即脱水，导致菌体蛋白质凝固而死亡。但需有一定的含量比例，以75%酒精溶液的杀菌力最强，常用于皮肤及器械消毒。
B、碘酊和碘甘油。 2%-5%的碘酊用于皮肤和手术部位的消毒；5%的碘甘油溶液可用于黏膜的消毒。如鸽痘剥痂后涂布于其创面。具体制法为：碘化钾10克，加入蒸馏水10毫升，等溶解后，再加入碘片5克与甘油20毫升，混合溶解后，再加蒸馏水至100毫升即成。
C、新洁尔灭溶液。 根据不同规格的新洁尔灭溶液，配成1：1000-1：2000的水溶液，可用于皮肤、黏膜、种蛋及用具的消毒。但切忌与肥皂及盐类相混，以免失效。 双氧水和高锰酸钾溶液 3%的双氧水溶液，适用于洗涤污秽、坏死和有臭气的陈旧创口；0.1%-0.5%的高锰酸钾溶液可冲洗创伤或腹腔黏膜，饮水防病。
D、硼酸和龙胆紫（甲紫）。 2%的硼酸溶液，可作鸽的鼻炎和眼结膜的冲洗剂。1%�3%的龙胆紫溶液（即紫药水），具有较强的杀菌力，常用于治疗创伤和溃疡，如适用于鸽痘剥痂涂布于其创面。
2、环境的消毒药物 。
A、毒杀（双链季铵盐消毒剂） 本品为新型、强效、速效、长效、广谱、低毒等优点的常用消毒制剂，对各种病毒、细菌及多种霉菌均有杀灭作用。水溶液无色无气味，无刺激性和腐蚀性，其消毒力长期保持，基本不受酸碱、粪污及光热的影响。它是低浓度瞬间杀菌，一般可持续7天的杀菌能力，穿透力强，对饮水、环境、器械消毒杀菌，口服、喷雾、冲洗均安全有效（使用比例可参见其瓶签详细说明）。
B、消毒王和抗毒威 消毒王系高效浓缩消毒剂，笼舍配用比例1：3000；饮水常规防疫1：12000（详见使用说明）。抗毒威，主含二氯异氧尿酸钠（优氯净），为新型含氯广谱消毒剂，呈白色粉未，易溶于水，新配的水溶液消毒力强。，约维持半天后渐弱。本品稍有氯的气味，但对人畜鸽无害。配用比例1：400（详见使用说明）。以上两种消毒药，均可喷洒、浸泡、饮水和种蛋消毒，对鸽舍、笼具、环境消毒以1：3000和1：400为宜；1：12000和1：4000适用于饮水消毒。
C、煤酚皂溶液（来苏儿）和克辽林（臭药水） 消毒力中等。用时加水30倍，一般用于浸泡医疗器械，以及解剖病死鸽时作消毒液，均可作鸽舍、鸽笼、排泄物的消毒；臭药水还可作鸽舍入口处的消毒。
D、福尔马林（36%-40%甲醛溶液） 5%-10%该溶液（或加10-20倍的水）适用于鸽舍或舍笼的消毒。但室内应在喷洒后关闭门窗，才能发挥熏蒸的作用。甲醛溶液，对病毒、病菌都有很强的杀伤力。该药挥发性很强，其气体有刺激性和毒性，可将细微孔隙中的微生物杀死，故适用于熏蒸消毒，可熏蒸鸽舍、孵化器、槽具及种蛋等。熏蒸方法：每立方米空间用福尔马林15�25毫升，置陶盆或搪瓷盆内，加等量清水，下面用电炉或炭炉加热，密封门窗及一切通风口，人在室外隔着玻璃观察，看到药液蒸发完时关掉电炉；如是炭炉，可用湿毛巾捂住口鼻，迅速进去将空盆从炉移开，以免烧坏。也可不进行加热，每立方米空间用高锰酸钾12.5克、福尔马林25毫升、清水12.5毫升，先将高锰酸钾放在盆内，再倒进加过水的福尔马林。这时操作人员急速退出，两药相混即起化学反应。但采取这种方法，约有40%的福尔马林在同高锰酸钾的化学反应中被消耗掉，在实践中不宜提倡使用。熏蒸鸽舍和孵化器，门窗应密闭24小时再打开，以充分发挥药效。熏蒸种蛋，每立方米空间只能用福尔马林15毫升，熏蒸20-30分钟，已开始孵化的种蛋不能熏蒸。如将种蛋先码到蛋盆上与孵化器一起熏蒸，经半小时应应开门，用电扇驱散药气，这样熏蒸的时间虽然不长，只要孵化器事先扫净擦净，蛋壳上又无粪污，也有良好的消毒效果

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